Fakültemiz; 1996 Yılında ‘96-8655 Sayılı Kanun Hükmünde Kararname’ uyarınca Y.Ö.K. ile Sağlık Bakanlığı arasında yapılan protokol çerçevesinde, Dumlupınar Üniversitesi bünyesinde Sağlık Yüksekokulu olarak kurulmuştur. 1997-1998 Eğitim Öğretim Yılı’nda eğitim ve öğretim faaliyetlerine başlamıştır. 

Sağlık Yüksekokulu; Kütahya Dumlupınar Üniversitesine Bağlı İken, 18 Mayıs 2018 tarihli Resmi Gazetede yayımlanan 7141 sayılı Yükseköğretim Kanunu ile Bazı Kanun ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun ile Kütahya Sağlık Bilimleri Üniversitesi bünyesinde Sağlık Bilimleri Fakültesine dönüştürülmüştür.

Fakültemiz bünyesinde, 12.16.2019 tarihli Yükseköğretim Yürütme Kurulu toplantısında Dil ve Konuşma Terapisi ve Ergoterapi Bölümlerinin açılması kararlaştırılmıştır. Dil ve Konuşma Terapisi Bölümü, 2020 tarihinde Kütahya Sağlık Bilimleri Üniversitesi Sağlık Bilimleri Fakültesi bünyesinde kurulmuş olup Dil ve Konuşma Terapisi Lisans Programı 2020-2021 eğitim-öğretim yılında faaliyete geçmiştir.